Nanopore：实时、超长、便携

Nanopore 测序由英国牛津纳米孔公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）开发，是另一种主流的三代测序技术。Oxford Nanopore (ONT)：分子被牵引通过蛋白或固态纳米孔，穿过孔时扰动离子电流产生“squiggle”信号，随后通过 base-calling 将信号转换成碱基序列。优点是实时产出、可做超长读（>100 kb 可达 Mb 级）和便携性强（如 MinION）。

测序原理

Nanopore 的核心是“让 DNA 分子穿过纳米孔，通过电流变化来识别碱基”：

纳米孔蛋白：固定在电阻膜上，形成纳米级孔道。

电信号检测：DNA 单链在电场驱动下穿过纳米孔，不同碱基（A、T、C、G）通过时产生独特的电流变化，实时识别碱基序列。

特点

读长：理论上无限，实践中可达 Mb 级

直接测序：能直接读 RNA 和碱基修饰（如甲基化）

便携实时：从 U 盘大小的 MinION 到 PromethION，都可以边测边出结果

这让 ONT 特别适合 现场测序（比如疫情期间快速检测病原体），也适合研究 超长重复区和端粒序列。