冷冻电镜行业的上游主要为核心零部件物镜、目镜、支架等提供厂商。这类公司存在如日本电子、日立、FEI均较高的专业壁垒，并且需要制造业在内的诸多学科及领域的人才，因此，资本和人才的门槛极高，专利及技术壁垒也极深，其关键竞争力在于底层自研的技术能力。

现阶段产业链上游均仅能依靠进口。透射式电镜的生产能力是冷冻电镜制造能力的基础之一，国内没有一家企业生产透射式电镜。

目前世界上生产透射电镜的厂商只有3家，分别是日本电子、日立、FEI。荷兰的FEI公司已经被美国赛默飞世尔科技公司收购，而后者在冷冻电镜市场占有率一家独大，与冷冻电镜配套的相机设备制造商也主要是美国Gatan公司，换言之美国基本垄断冷冻电镜制造市场。