PacBio平台，作为长读测序领域中的佼佼者，采用单分子实时测序（SMRT）技术，为RNA测序带来了前所未有的突破。其核心原理在于利用零模波导孔（ZMWs），让DNA聚合酶在其中毫无间断地合成新链。这种技术使得PacBio能够轻松应对长达数千碱基的序列读取，为全长RNA测序提供了坚实的技术支撑。

与Oxford Nanopore Technologies（ONT）测序技术不同，通过循环共识测序（CCS），PacBio能够实现对同一条cDNA分子的多次测序，从而生成高保真（HIFI）的序列数据，准确率可以更高。这使得在处理复杂基因结构和低表达基因时，PacBio 能够提供更为可靠的结果。PacBio的读长优势也不容小觑。其RNA测序平均读长可达约2.1kb，能够很好地覆盖完整基因转录本，减少因片段过短而导致的信息缺失。